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MICHAEL HEMANN : Aujourd'hui, nous allons
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00:00:01,375 --> 00:00:07,230
pour parler d'analyse de liens.
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00:00:07,230 --> 00:00:12,540
Et cela implique d'identifier où se trouve un gène particulier
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00:00:12,540 --> 00:00:13,630
sur un chromosome.
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00:00:13,630 --> 00:00:16,680
Nous avons donc localisé les chromosomes dans le passé,
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00:00:16,680 --> 00:00:21,400
maintenant nous localisons les gènes les uns par rapport aux autres.
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00:00:21,400 --> 00:00:23,830
Alors pourquoi voulons-nous faire cela ?
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00:00:23,830 --> 00:00:25,630
Pourquoi nous en soucions-nous ?
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00:00:25,630 --> 00:00:29,430
Eh bien, c’est en fait ce que font les généticiens.
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00:00:29,430 --> 00:00:32,040
On essaie en fait de partir des phénotypes
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00:00:32,040 --> 00:00:33,780
et cartographier les emplacements des gènes.
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00:00:33,780 --> 00:00:39,390
Et en localisant ces gènes, identifier les causes génétiques
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00:00:39,390 --> 00:00:43,420
ou les fondements des phénotypes qui nous intéressent.
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00:00:43,420 --> 00:00:48,060
On peut par exemple parler de variabilité génétique
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00:00:48,060 --> 00:00:49,740
dans les populations et pourquoi certaines personnes sont
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00:00:49,740 --> 00:00:52,420
plus sensibles au COVID que les autres.
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00:00:52,420 --> 00:00:54,420
Et ce genre d'étude a été réalisé récemment,
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00:00:54,420 --> 00:00:56,665
et nous en parlerons dans quelques conférences,
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00:00:56,665 --> 00:00:58,290
et tu parleras de ce genre de travail
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00:00:58,290 --> 00:01:01,140
plus tard dans le semestre avec Olivia Corradin parlant
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00:01:01,140 --> 00:01:03,150
sur les études d'association à l'échelle du génome.
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00:01:03,150 --> 00:01:05,400
Mais c'est ainsi qu'on part de quelque chose
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00:01:05,400 --> 00:01:09,690
que nous obtenons une image moléculaire détaillée et réelle
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00:01:09,690 --> 00:01:12,210
de quelle est l'étiologie de cette condition.
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00:01:12,210 --> 00:01:15,090
Cela nous permet d'identifier les gènes et les altérations des gènes,
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00:01:15,090 --> 00:01:17,700
et idéalement identifier les thérapeutiques
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00:01:17,700 --> 00:01:24,180
que nous pouvons utiliser pour réellement affecter ou corriger quelque chose
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00:01:24,180 --> 00:01:26,910
qu'on voit comme un défaut, ou chez quelqu'un qui est résistant,
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00:01:26,910 --> 00:01:30,000
par exemple, au COVID, peut-on y identifier une thérapeutique
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00:01:30,000 --> 00:01:32,280
ça aiderait d'autres personnes ?
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00:01:32,280 --> 00:01:35,430
La cartographie est donc vraiment essentielle et l'est vraiment
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00:01:35,430 --> 00:01:37,440
le pain et le beurre de ce que font les généticiens.
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00:01:37,440 --> 00:01:39,360
Nous allons donc en parler, en gros,
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00:01:39,360 --> 00:01:43,470
dans les quatre ou cinq prochaines conférences.
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00:01:43,470 --> 00:01:46,680
Et donc nous allons commencer, comme nous le faisons souvent
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00:01:46,680 --> 00:01:50,820
faire, dans un organisme modèle avec lequel nous sommes à l'aise ici,
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00:01:50,820 --> 00:01:52,560
je parle de drosophile.
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00:01:52,560 --> 00:01:55,560
Et donc ici, je montre le chromosome de la drosophile
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00:01:55,560 --> 00:01:56,850
schématisé.
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00:01:56,850 --> 00:02:00,180
Auparavant, nous avons cartographié les gènes sur des chromosomes particuliers,
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00:02:00,180 --> 00:02:01,920
comme le chromosome X.
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00:02:01,920 --> 00:02:05,640
Mais que se passe-t-il si nous voulons réellement cartographier les gènes sur le chromosome X ?
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00:02:05,640 --> 00:02:06,880
les uns par rapport aux autres ?
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00:02:06,880 --> 00:02:10,889
Nous voulons essentiellement déterminer à quelle distance ils se trouvent d'un
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00:02:10,889 --> 00:02:14,520
un autre pour que nous puissions commencer à construire une carte où tous ces éléments
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00:02:14,520 --> 00:02:17,970
loci, ou sont tous ces lieux qui sont délimités.
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00:02:17,970 --> 00:02:20,280
Et donc si nous avons un nouveau gène, nous pouvons le localiser
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00:02:20,280 --> 00:02:23,280
à côté de ces localisations, de ces phénotypes,
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00:02:23,280 --> 00:02:27,060
et identifier quelle est la cause de l’altération ou de la mutation
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00:02:27,060 --> 00:02:30,960
qui sous-tendent ces modifications.
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00:02:30,960 --> 00:02:37,150
Supposons donc que nous ayons deux altérations sur le chromosome X.
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00:02:37,150 --> 00:02:42,850
On peut donc écrire ici des génotypes et des phénotypes.
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00:02:42,850 --> 00:02:47,300
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00:02:47,300 --> 00:02:53,910
Et nos génotypes de chromosomes X peuvent être, par exemple,
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00:02:53,910 --> 00:02:56,780
si nous regardons deux gènes, l'un est celui des yeux blancs,
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00:02:56,780 --> 00:02:58,883
ou la mutation provoque un phénotype des yeux blancs,
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00:02:58,883 --> 00:03:00,050
et l'autre est des mini ailes.
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00:03:00,050 --> 00:03:02,210
Alors des yeux blancs et des petites ailes, ceux-là
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00:03:02,210 --> 00:03:05,900
sont les choses auxquelles pensent les biologistes de la drosophile.
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00:03:05,900 --> 00:03:13,890
Donc si vous êtes w plus et m plus sur le chromosome X,
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00:03:13,890 --> 00:03:14,790
tu es du type sauvage.
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00:03:14,790 --> 00:03:18,410
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00:03:18,410 --> 00:03:31,490
Si vous êtes w plus et m moins, vous avez des mini ailes avec des ailes.
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00:03:31,490 --> 00:03:40,370
Si vous êtes w moins m plus, vous avez les yeux blancs.
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00:03:40,370 --> 00:03:43,390
Donc trois phénotypes que nous pouvons...
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00:03:43,390 --> 00:03:45,970
deux phénotypes et un manque de ceux-ci que l'on peut clairement
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00:03:45,970 --> 00:03:49,450
voir chez les mouches mâles.
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00:03:49,450 --> 00:03:51,490
Alors faisons une petite croix.
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00:03:51,490 --> 00:03:58,760
Nous allons donc commencer par un mâle aux yeux blancs.
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00:03:58,760 --> 00:04:02,330
Et nous passerons à une femelle mini ailes.
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00:04:02,330 --> 00:04:13,180
Donc w plus m moins w plus m moins sur les deux chromosomes.
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00:04:13,180 --> 00:04:18,019
Ainsi donc la progéniture de ce croisement, si vous êtes une femelle,
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00:04:18,019 --> 00:04:20,589
les femelles seront hétérozygotes aux deux niveaux
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00:04:20,589 --> 00:04:21,610
de ces lieux.
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00:04:21,610 --> 00:04:25,600
Ils auront donc un allèle w moins m plus
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00:04:25,600 --> 00:04:29,815
et un allèle qui est w plus m moins.
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00:04:29,815 --> 00:04:33,830
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00:04:33,830 --> 00:04:38,850
On peut prendre cette femelle, cette femelle double hétérozygote,
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00:04:38,850 --> 00:04:42,680
et croisement avec un mâle de type sauvage.
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00:04:42,680 --> 00:04:45,650
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00:04:45,650 --> 00:04:49,700
Et nous ferons cela juste pour voir les interactions des deux
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00:04:49,700 --> 00:04:53,100
chromosomes chez cette femelle.
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00:04:53,100 --> 00:04:56,120
Nous voulons donc savoir si ces deux allèles sont
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00:04:56,120 --> 00:04:59,660
Restent-ils ensemble ou s'éloignent-ils les uns des autres ?
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00:04:59,660 --> 00:05:02,850
Y a-t-il une recombinaison qui se produit ?
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00:05:02,850 --> 00:05:07,500
Donc à partir de ce croisement, nous avons essentiellement
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00:05:07,500 --> 00:05:12,090
obtenez deux catégories de mouches mâles.
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00:05:12,090 --> 00:05:13,890
Alors l'un d'eux...
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00:05:13,890 --> 00:05:25,940
la catégorie aura w moins m plus ou w plus m moins.
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00:05:25,940 --> 00:05:28,430
Et c'est ce que nous appellerons parental.
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00:05:28,430 --> 00:05:34,850
Et nous l'appellerons parental parce que les allèles ici
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00:05:34,850 --> 00:05:38,270
sont les mêmes allèles que nous voyons, essentiellement,
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00:05:38,270 --> 00:05:42,990
dans ces types parentaux ci-dessus.
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00:05:42,990 --> 00:05:46,920
Donc ils suggèrent qu'il n'y a pas de recombinaison ici,
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00:05:46,920 --> 00:05:49,260
qu'ils sont restés ensemble sur le même chromosome.
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00:05:49,260 --> 00:05:50,770
Ils sont sur le chromosome X.
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00:05:50,770 --> 00:05:53,430
Ils ne se sont donc pas éloignés les uns des autres.
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00:05:53,430 --> 00:05:55,380
Alternativement, nous pouvons suivre différents cours.
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00:05:55,380 --> 00:05:57,750
Et donc l'une des différentes classes que nous pouvons obtenir
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00:05:57,750 --> 00:06:06,880
est w moins m moins, ou w plus m plus.
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00:06:06,880 --> 00:06:09,310
Donc quelque chose s'est passé ici.
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00:06:09,310 --> 00:06:12,760
Il y a eu un certain réassortiment d'allèles.
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00:06:12,760 --> 00:06:24,200
C’est pourquoi nous appelons ces recombinants ou croisements.
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00:06:24,200 --> 00:06:29,450
Parce qu'ils ne sont pas représentés dans la classe parentale.
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00:06:29,450 --> 00:06:32,360
Nous pouvons donc énumérer les ratios relatifs
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00:06:32,360 --> 00:06:34,460
de ces parents par rapport à ces
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00:06:34,460 --> 00:06:36,910
recombinants ou crossovers.
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00:06:36,910 --> 00:06:42,240
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00:06:42,240 --> 00:06:47,800
Et donc si le nombre de parents
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00:06:47,800 --> 00:06:52,940
est égal au nombre de croisements ou de recombinants,
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00:06:52,940 --> 00:06:59,290
alors nous appelons ces locus non liés.
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00:06:59,290 --> 00:07:02,955
C'est donc la caractéristique de l'assortiment indépendant.
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00:07:02,955 --> 00:07:04,330
C'est ce que nous verrions s'ils
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00:07:04,330 --> 00:07:06,310
étaient sur des chromosomes différents.
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00:07:06,310 --> 00:07:20,780
Donc si les parents dépassent le nombre de croisements,
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00:07:20,780 --> 00:07:25,760
et on dit qu'ils sont un peu plus,
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00:07:25,760 --> 00:07:33,980
alors on dira que ceux-ci sont faiblement liés,
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00:07:33,980 --> 00:07:36,830
ce qui signifie qu'ils sont sur le même chromosome,
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00:07:36,830 --> 00:07:40,370
mais ils sont probablement à une certaine distance les uns des autres.
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00:07:40,370 --> 00:07:51,880
Donc finalement, si nous avons beaucoup plus de parents, alors les croisements,
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00:07:51,880 --> 00:07:58,010
on dira qu'ils sont étroitement liés,
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00:07:58,010 --> 00:08:00,570
qu'ils ne s'éloignent vraiment pas les uns des autres.
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00:08:00,570 --> 00:08:04,700
Et en fait, quand ils sont vraiment très proches l'un de l'autre,
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00:08:04,700 --> 00:08:12,990
les croisements peuvent ne pas apparaître.
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00:08:12,990 --> 00:08:15,270
S'ils sont vraiment très étroitement liés,
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00:08:15,270 --> 00:08:20,150
ces crossovers vont être vraiment, vraiment rares.
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